Alpha Protocol to gra akcji z mocno rozbudowanymi elementami RPG w której wcielamy się w tajnego agenta Michaela Thortona wyszkolonego przez najlepszych ludzi z CIA. Thorton żeby zapobiec międzynarodowej katastrofie musi porzucić dotychczasowe życie i przejść w stan całkowitej konspiracji. W grze będziemy mieć możliwość rozmowy z wieloma różnymi postaciami a nasze odpowiedzi będą miały wpływ na dalszy rozwój wydarzeń. Walki rozgrywają się w czasie rzeczywistym lecz z możliwościa włączenia aktywnej pauzy. Producent Obsidian Entertainment postarał się nietylko o doskonałą fabułe gry ale i również o oprawę audio wizualną która stoi na wysokim poziomie.